Načítají se data…Jak silná je chřipková sezóna, kam míří a co čekat za měsíc: týdenní nemocnost ILI a ARI proti prahům metody MEM, trend růstu a čtyřtýdenní předpověď evropského hubu RespiCast.
Jak se pozná trend a jak často se trefuje
Metoda
Z posledních tří týdnů se váženou regresí spočítá tempo růstu a pravděpodobnost, že je sklon opravdu kladný. Váhou je počet případů — týden se stovkami případů řekne víc než týden s desítkami.
ln( případy / populace ) = a + r · týden
změna za týden = e^r − 1
P(růst) = P( T[n−2] < r / SE ) (Studentovo t)
Kategorie podle P(růst): nad 90 % roste · 75–90 % pravděpodobně roste · 25–75 % beze změny · 10–25 % pravděpodobně klesá · pod 10 % klesá.
Proč ne reprodukční číslo R. R patří jednomu patogenu se známým generačním intervalem. ILI a ARI jsou směs chřipky, RSV, covidu a rhinovirů — jedno R pro ně neexistuje a převod by byl přesný jen naoko.
Studie
- CDC, Center for Forecasting and Outbreak Analytics: Current Epidemic Trends (Based on Rt) — odtud kategorie a hranice pravděpodobností.
- Wallinga J., Lipsitch M. (2007): How generation intervals shape the relationship between growth rates and reproductive numbers. Proc. R. Soc. B 274 — proč tempo růstu nese stejnou informaci jako R.
Jak jsme to testovali
Na minulých sezónách: když portál řekl…, další týden nemocnost opravdu vzrostla:
Délku okna (3 týdny) rozhodl právě tenhle test. S okny 4 a 5 týdnů se pořadí kategorií rozpadá a kolem vrcholu se „roste“ hlásí ještě dva týdny po obratu.
Omezení dat
- Trend popisuje poslední tři týdny, nepředpovídá. I po „roste“ další týden nemocnost ve třetině případů klesla.
- Sváteční týdny (52, 53, 1) hlášení skokově sníží a pak zvýší — trend přes ně nese upozornění a do testu se nepočítá.
- Letní pauza. Zhruba od týdne 21 do 35 se nehlásí; dokud po ní nejsou tři souvislé týdny, trend není.
- Čerstvé týdny se ještě dohlašují, poslední bod se může zpětně posunout.
Týdenní nemocnost ILI proti prahům intenzity
ILI na 100 tis. obyvatel · říjen až květen (kalendářní týdny 40–20) · celá ČR
Kalendářní týden je týden podle normy ISO: od pondělí do neděle, týden 1 je ten s prvním čtvrtkem roku. Sezóna se sleduje od týdne 40 (přelom září a října) do týdne 20 (polovina května). ILI = chřipce podobné onemocnění hlášené praktickými lékaři, přepočtené na 100 tis. obyvatel pokryté populace. Jde o klinickou diagnózu, ne laboratorně potvrzenou chřipku. Nahoře na stránce je vždy poslední hlášený týden. Graf ukazuje běžící sezónu, jakmile má první hlášení v sezónním okně; do té doby poslední uzavřenou sezónu, kterou lze přehrát posuvníkem — běžící sezóna jde vybrat i tak.
Jak se prahy počítají, jak jsme to ověřili a kde má metoda slabiny
Metoda
Moving Epidemic Method (MEM) — standard ECDC a WHO pro chřipkovou surveillance. Tři kroky:
- V každé minulé sezóně se najde epidemické období. Pro každou délku r se vezme r po sobě jdoucích týdnů s největším součtem a spočítá se, kolik procent celé sezóny pokrývají. Epidemie trvá, dokud přidaný týden přináší aspoň δ = 2,8 % sezóny.
t(r) = max Σ x[i..i+r−1] / Σ x · 100
Δ(r) = t̃(r) − t̃(r−1) (t̃ = vyhlazená křivka)
délka epidemie = poslední r, kde Δ(r) ≥ δ
- Epidemický práh z nejvyšších týdnů před epidemií: hodnota, kterou klidný týden překročí jen v 5 % případů.
práh = průměr + 1,645 · sd
- Pásma intenzity z nejvyšších týdnů během epidemií, na logaritmické škále (vrcholy jsou zhruba lognormální):
hranice = exp( průměr(ln x) + z · sd(ln x) )
z = −0,253 · 1,282 · 1,960 (40. · 90. · 97,5. percentil)
Z každé sezóny jdou do odhadu 3 nejvyšší týdny (30 hodnot děleno počtem sezón).
Studie
- Vega T. a kol. (2013): Influenza surveillance in Europe: establishing epidemic thresholds by the Moving Epidemic Method. Influenza and Other Respiratory Viruses 7(4).
- Vega T. a kol. (2015): Influenza surveillance in Europe: comparing intensity levels calculated using the MEM. IORV 9(5).
- WHO (2017, revize 2024): Pandemic Influenza Severity Assessment (PISA) — rámec, který MEM doporučuje.
- Referenční implementace: R balík
mem(J. E. Lozano).
Jak jsme to testovali
- Shoda s referencí. Náš výpočet dává na českých datech i na umělých sezónách stejné prahy a stejné začátky a konce epidemií jako R balík
mem2.19 — na deset platných číslic. Hlídá to automatický test při každé změně kódu. - Zpětný test po sezónách. Prahy se spočítají bez jedné sezóny a na ní se vyzkouší. Epidemický práh takto zachytil epidemických týdnů a mimo epidemii mlčel v týdnů.
- Citlivost na δ. Zkoušeli jsme δ od 2,0 do 4,0 %. Rozdíly jsou v šumu, proto zůstává standardních 2,8 — prahy jsou tak srovnatelné s jinými zeměmi.
Omezení dat
- ILI je klinická diagnóza, ne laboratorně potvrzená chřipka. Do čísla se promítají i jiné viry se stejnými příznaky.
- Deset sezón je málo. Pásmo „velmi vysoká“ stojí na extrapolaci — tak silnou sezónu data neobsahují.
- Hlásí jen část ordinací. Pokrytá populace se mění; ve FluID skočila v sezóně 2025/26 z 5,4 na 8,5 mil., proto ta sezóna do prahů zatím nejde.
- Svátky. Kolem Vánoc ordinace nehlásí a křivka má umělý zub.
Do odhadu jde posledních deset sezón, ve kterých epidemie proběhla. Vynechané:
Aktuální výhled na čtyři týdny
Odkud je předpověď, jak se počítá pravděpodobnost a jak jí věřit
Metoda
Předpověď je ensemble evropského hubu RespiCast (ECDC, ISI Foundation, LSHTM). Desítky týmů každý týden pošlou svůj model — klasickou statistiku (ARIMA, Kalmanův filtr), epidemiologické modely (SEIR), strojové učení (LightGBM, N-BEATS, LSTM) i základové modely pro časové řady — a hub je složí do jedné předpovědi s 23 kvantily. Portál ji přebírá beze změny.
Sami dopočítáváme jen pravděpodobnost překročení českého epidemického prahu: z kvantilů se složí distribuční funkce a odečte se, kolik pravděpodobnosti leží nad prahem. Mimo rozsah předpovědi netvrdíme 0 ani 100 %, jen 1 nebo 99 %.
P( X ≥ práh ) = 1 − F(práh)
F = lineárně mezi sousedními kvantily
Studie
- ECDC: The European Respiratory Diseases Forecasting Hub (RespiCast); vyhodnocení sezóny 2023/24 (medRxiv 2025).
- Bracher J. a kol. (2021): Evaluating epidemic forecasts in an interval format. PLOS Computational Biology — skóre WIS.
- CDC FluSight: deset let vyhodnocování ukazuje, že ensemble je spolehlivější než jednotlivé modely.
Jak jsme to testovali
Každou minulou předpověď pro ČR porovnáváme se skutečností a s referenčním modelem hubu („bude to jako minulý týden“), metrikou WIS — trestá široké intervaly i to, když skutečnost padne mimo ně.
Omezení dat
- Pásy jsou užší, než slibují. Zkoušeli jsme je roztáhnout; škála z jedné sezóny se na druhou nepřenesla, proto ukazujeme původní předpověď a vedle ní její skutečnou úspěšnost.
- Nástup vlny předpověď nevidí. Tři týdny před začátkem epidemie 2024/25 dávala překročení prahu 1 %. Včasné varování je práce epidemického prahu a trendu, ne předpovědi.
- Dvě sezóny historie. Hub běží od října 2024; úspěšnost se mezi sezónami liší.
- Zpoždění dat. Hlášení chodí s dvoutýdenním odstupem, první dva „předpovídané“ týdny jsou ve skutečnosti odhad přítomnosti.
Co předpověď říkala v přehrávaném týdnu
ILI a ARI — dvě čísla z týchž ordinací
ILI — chřipce podobné onemocnění. Náhlý začátek, horečka nebo schvácenost a k tomu kašel či bolest v krku. Úzká definice: běžnou rýmu odfiltruje, takže křivka sleduje hlavně chřipku. Vlna ji zvedne zhruba patnáctkrát nad podzimní klid.
ARI — akutní respirační infekce. Stačí jeden respirační příznak. Spadá sem všechno, co se zrovna točí: rhinoviry, RSV, covid i chřipka (ILI je podmnožinou ARI). Vlna ji zvedne jen asi dvakrát, ale je to číslo, ve kterém tradičně mluví česká hygiena.
Všechny akutní respirační infekce (ARI)
ARI na 100 tis. obyvatel · stejná sezóna a týden jako nahoře · celá ČR
U ARI záměrně chybí pásma intenzity: chřipková vlna se v ní ztrácí v celoročním pozadí jiných virů a pásma by předstírala přesnost, kterou data nemají. Práh je orientační čára spočítaná metodou MEM — není to úřední hranice, kterou pro vyhlášení epidemie používají hygienici.
Proč u ARI nejsou pásma intenzity
Metoda
Stejný výpočet MEM jako u ILI. ARI je ale skoro plochá řada: i mimo vlnu nese každý týden kolem 3 % sezóny, takže metoda těžko pozná, kde epidemie začíná a končí.
Jak jsme to testovali
Zpětný test po sezónách: epidemický práh u ARI zachytil jen epidemických týdnů (u ILI ). Pod hranicí spolehlivosti, kterou jsme si stanovili předem, portál pásma nekreslí — data nesou příznak intensity_reliable.
Omezení dat
- ARI zahrnuje všechny respirační infekce; chřipková vlna ji zvedne jen asi dvakrát.
- Práh na grafu je výsledek metody MEM, ne úřední hranice, podle které epidemii vyhlašují hygienici.
- Tři mírnější sezóny vyšly jako „bez epidemie“ a do odhadu nejdou.
Jak dopadly minulé sezóny
Metoda: Moving Epidemic Method (Vega a kol. 2013, 2015) · výpočet ověřen proti referenčnímu R balíku mem ·
implementace a testy v repozitáři
pathogensportal-db ·
laboratorní data o chřipce jsou na stránce Chřipka a respirační viry